Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
USP5P45974 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP5P45974 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
USP5P45974 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP5P45974 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP5P45974 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP5P45974 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP5P45974 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP5P45974 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
USP5P45974 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP5P45974 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP5P45974 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP5P45974 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
USP5P45974 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP5P45974 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP5P45974 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP5P45974 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
USP5P45974 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP5P45974 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP5P45974 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP5P45974 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP5P45974 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP5P45974 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP5P45974 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
USP5P45974 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
USP5P45974 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP5P45974 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP5P45974 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP5P45974 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP5P45974 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP5P45974 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP5P45974 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
USP5P45974 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms