Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3CBP42338 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3CBP42338 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms