Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGFBR1P36897 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms