Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP6P35125 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP6P35125 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP6P35125 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP6P35125 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP6P35125 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP6P35125 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP6P35125 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP6P35125 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP6P35125 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP6P35125 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP6P35125 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP6P35125 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP6P35125 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP6P35125 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP6P35125 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP6P35125 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP6P35125 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP6P35125 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP6P35125 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP6P35125 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP6P35125 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP6P35125 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
USP6P35125 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
USP6P35125 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
USP6P35125 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP6P35125 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP6P35125 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP6P35125 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP6P35125 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP6P35125 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP6P35125 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP6P35125 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP6P35125 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP6P35125 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP6P35125 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP6P35125 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP6P35125 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP6P35125 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP6P35125 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP6P35125 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP6P35125 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP6P35125 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP6P35125 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP6P35125 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP6P35125 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP6P35125 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP6P35125 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP6P35125 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP6P35125 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP6P35125 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP6P35125 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP6P35125 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP6P35125 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP6P35125 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP6P35125 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP6P35125 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP6P35125 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP6P35125 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP6P35125 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP6P35125 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP6P35125 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP6P35125 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP6P35125 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP6P35125 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP6P35125 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP6P35125 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP6P35125 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP6P35125 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP6P35125 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP6P35125 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP6P35125 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP6P35125 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms