Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKBRP32239 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms