Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ITGA3P26006 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA3P26006 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms