Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMA4P25789 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms