Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
POLR2AP24928 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
POLR2AP24928 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms