Protein–RNA interactions for Protein: P21964

COMT, Catechol O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMTP21964 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMTP21964 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMTP21964 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMTP21964 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMTP21964 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMTP21964 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMTP21964 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMTP21964 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMTP21964 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMTP21964 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COMTP21964 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMTP21964 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMTP21964 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMTP21964 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMTP21964 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMTP21964 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMTP21964 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMTP21964 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMTP21964 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMTP21964 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMTP21964 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COMTP21964 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMTP21964 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMTP21964 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMTP21964 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COMTP21964 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COMTP21964 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COMTP21964 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms