Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERBB3P21860 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms