Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CD247P20963 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD247P20963 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CD247P20963 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD247P20963 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms