Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
XBP1P17861 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
XBP1P17861 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
XBP1P17861 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
XBP1P17861 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
XBP1P17861 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
XBP1P17861 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XBP1P17861 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XBP1P17861 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
XBP1P17861 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XBP1P17861 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
XBP1P17861 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XBP1P17861 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
XBP1P17861 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
XBP1P17861 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
XBP1P17861 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
XBP1P17861 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
XBP1P17861 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XBP1P17861 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
XBP1P17861 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XBP1P17861 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
XBP1P17861 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
XBP1P17861 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
XBP1P17861 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
XBP1P17861 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XBP1P17861 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XBP1P17861 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
XBP1P17861 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XBP1P17861 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XBP1P17861 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XBP1P17861 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XBP1P17861 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XBP1P17861 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
XBP1P17861 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XBP1P17861 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
XBP1P17861 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XBP1P17861 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XBP1P17861 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XBP1P17861 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms