Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACADSP16219 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACADSP16219 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACADSP16219 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACADSP16219 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACADSP16219 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACADSP16219 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACADSP16219 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACADSP16219 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACADSP16219 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms