Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF35P13682 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms