Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NR2C1P13056 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2C1P13056 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms