Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLUP10909 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLUP10909 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLUP10909 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLUP10909 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLUP10909 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLUP10909 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLUP10909 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms