Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3P09919 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3P09919 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3P09919 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3P09919 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3P09919 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3P09919 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF3P09919 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF3P09919 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF3P09919 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF3P09919 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF3P09919 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF3P09919 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF3P09919 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF3P09919 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF3P09919 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF3P09919 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF3P09919 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSF3P09919 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3P09919 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3P09919 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3P09919 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3P09919 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF3P09919 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms