Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
PKHD1P08F94 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PKHD1P08F94 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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