Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPBP07199 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPBP07199 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPBP07199 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPBP07199 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBP07199 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBP07199 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBP07199 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBP07199 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBP07199 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBP07199 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBP07199 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBP07199 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBP07199 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBP07199 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBP07199 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBP07199 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBP07199 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBP07199 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBP07199 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBP07199 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBP07199 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBP07199 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBP07199 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBP07199 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBP07199 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBP07199 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBP07199 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBP07199 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBP07199 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBP07199 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBP07199 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms