Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYBBP04839 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYBBP04839 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYBBP04839 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYBBP04839 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYBBP04839 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYBBP04839 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYBBP04839 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYBBP04839 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYBBP04839 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYBBP04839 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYBBP04839 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYBBP04839 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYBBP04839 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYBBP04839 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYBBP04839 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYBBP04839 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYBBP04839 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYBBP04839 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYBBP04839 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYBBP04839 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CYBBP04839 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYBBP04839 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYBBP04839 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYBBP04839 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYBBP04839 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYBBP04839 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYBBP04839 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYBBP04839 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CYBBP04839 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CYBBP04839 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms