Protein–RNA interactions for Protein: P01037

CST1, Cystatin-SN, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST1P01037 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CST1P01037 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CST1P01037 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CST1P01037 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CST1P01037 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CST1P01037 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CST1P01037 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CST1P01037 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CST1P01037 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CST1P01037 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CST1P01037 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CST1P01037 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CST1P01037 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CST1P01037 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CST1P01037 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST1P01037 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST1P01037 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST1P01037 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST1P01037 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST1P01037 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST1P01037 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST1P01037 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CST1P01037 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST1P01037 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST1P01037 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST1P01037 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST1P01037 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CST1P01037 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST1P01037 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST1P01037 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CST1P01037 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms