Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SIN3BO75182 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms