Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NDUFS4O43181 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms