Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APAF1O14727 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APAF1O14727 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APAF1O14727 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APAF1O14727 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APAF1O14727 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APAF1O14727 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APAF1O14727 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APAF1O14727 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APAF1O14727 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APAF1O14727 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APAF1O14727 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APAF1O14727 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APAF1O14727 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APAF1O14727 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APAF1O14727 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APAF1O14727 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APAF1O14727 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APAF1O14727 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APAF1O14727 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APAF1O14727 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APAF1O14727 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
APAF1O14727 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APAF1O14727 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APAF1O14727 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APAF1O14727 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APAF1O14727 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APAF1O14727 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APAF1O14727 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APAF1O14727 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APAF1O14727 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APAF1O14727 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APAF1O14727 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms