Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GOLGA8SH3BPF8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms