Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HHLA1C9JL84 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HHLA1C9JL84 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms