Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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C9orf172C9J069 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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C9orf172C9J069 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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C9orf172C9J069 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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C9orf172C9J069 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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C9orf172C9J069 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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C9orf172C9J069 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf172C9J069 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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