Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms