Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC160A6NGH7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms