Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
PTPDC1A2A3K4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPDC1A2A3K4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms