Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GPR55Q9Y2T6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms