Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF6Q9Y252 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF6Q9Y252 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms