Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT1Q9Y234 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms