Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SHOC2Q9UQ13 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms