Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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RABGEF1Q9UJ41 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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RABGEF1Q9UJ41 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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RABGEF1Q9UJ41 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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RABGEF1Q9UJ41 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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RABGEF1Q9UJ41 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RABGEF1Q9UJ41 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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