Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms