Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPC1L1Q9UHC9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms