Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms