Protein–RNA interactions for Protein: Q9P000

COMMD9, COMM domain-containing protein 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD9Q9P000 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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COMMD9Q9P000 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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COMMD9Q9P000 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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COMMD9Q9P000 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COMMD9Q9P000 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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