Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSD3Q9NYI0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSD3Q9NYI0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms