Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PNPLA3Q9NST1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms