Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CMC2Q9NRP2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms