Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IL1RAPQ9NPH3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms