Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLRP1Q9C000 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms