Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLDIP3Q9BY77 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms