Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5DQ9BY66 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5DQ9BY66 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5DQ9BY66 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5DQ9BY66 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5DQ9BY66 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5DQ9BY66 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5DQ9BY66 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5DQ9BY66 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5DQ9BY66 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5DQ9BY66 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5DQ9BY66 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5DQ9BY66 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5DQ9BY66 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5DQ9BY66 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5DQ9BY66 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM5DQ9BY66 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM5DQ9BY66 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms