Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TDRD1Q9BXT4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms