Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TINF2Q9BSI4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TINF2Q9BSI4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TINF2Q9BSI4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TINF2Q9BSI4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TINF2Q9BSI4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TINF2Q9BSI4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TINF2Q9BSI4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TINF2Q9BSI4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TINF2Q9BSI4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TINF2Q9BSI4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TINF2Q9BSI4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TINF2Q9BSI4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TINF2Q9BSI4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TINF2Q9BSI4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TINF2Q9BSI4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TINF2Q9BSI4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TINF2Q9BSI4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TINF2Q9BSI4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms