Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ6

CHCHD6, MICOS complex subunit MIC25, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD6Q9BRQ6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHCHD6Q9BRQ6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms