Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBA1CQ9BQE3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms